Un buen punto de partida es entender el modelo OSI o el modelo TCP/IP. Te da un mapa de las diferentes "capas" de la comunicación. Luego, céntrate en los protocolos clave para un desarrollador web: HTTP, DNS, TCP/IP. Entender cómo funciona una petición DNS o el "three-way handshake" de TCP te abrirá los ojos.
El canal de YouTube de PowerCert Animated Videos tiene vídeos súper claros y visuales sobre estos temas.