¡Bienvenido al lado open source de la virtualización, @justen_dare2! Haces muy bien en migrar.
Respondo rápido:
1. ZFS: Totalmente recomendado, sobre todo si vas a usar TrueNAS. La regla general es 1GB de RAM por cada 1TB de almacenamiento, pero para un homelab puedes ser más flexible. La protección contra la corrupción de datos (bit rot) y los snapshots son una pasada.
2. Proxmox Backup Server (PBS): Es espectacular. Instálalo en una máquina aparte (incluso una RPi 4 con un disco USB te sirve para empezar). Los backups son incrementales y deduplicados, ahorras un montón de espacio y son rapidísimos. La integración es nativa y muy sencilla.
3. Migración: Lo más "tedioso" es pasar los discos VMDK de VMware a un formato que Proxmox lea bien (como qcow2). Hay guías por ahí, busca "convert vmdk to qcow2". ¡Paciencia en ese paso y todo irá bien!